Oznámení o HIV

Po vyšetření před sezónou 1991-1992 se ukázalo, že je Johnson nakažený virem HIV. Na tiskové konferenci 7 listopadu 1991 oznámil okamžité ukončení kariéry. Řekl, že jeho žena Cookie a jejich nenarozené dítě nejsou nakaženi a že svůj život věnuje "boji proti této smrtelné nákaze". Johnson nejdříve říkal, že neví, jak se mohl nakazit, ale později přiznal, že za tím stáli jeho sexuální partneři. V té době mělo jen malé procento amerických mužů nákazu zapříčiněnou heterosexuálním stykem a i Johnson se tak nevyhnul obvinění z homosexuální orientace. Všechno to ale dlouho popíral. Johnsonovo oznámení každopádně vyvolalo v médiích obrovský rozruch, ačkoli například i prezident George H. W. Bush ho označil za hrdinu.

I přesto, že ukončil kariéru, byl Johnson fanoušky vybrán jako člen základní sestavy All-Star týmu v roce 1992. I přes protesty hráčů (Byron Scott, A.C.Green nebo Karl Malone) se Johnson utkání zúčastnil a s 25 body a 9 asistencemi vyhrál cenu MVP pro tento zápas. Po jeho trojce v poslední minutě byl zápas ukončen, když na palubovku běželi hráči obou týmů Johnsonovi gratulovat.

Magic se dostal i do výběru americké reprezentace pro Olympijské hry v roce 1992 a stal se tak členem legendárního "Dream Teamu". V něm hráli hráči jako Jordan, Bird, Barkley a tento výběr byl považován za neporazitelný. A také na turnaji to potvrdil, když vyhrál všech 8 zápasů s průměrným rozdílem o 43,8 bodů. Na tomto turnaji hrál střídavě po problémech s kolenem, ale vždy se mu dostalo velkých ovací od publika. Johnson tuto příležitost využil, aby inspiroval bojem proti HIV.

Život po Olympijských hrách

Před sezónou 1992-1993 oznámil Johnson svůj záměr vrátit se ke hře, ale to se setkalo s protesty několika hráčů. V roce 2011 Johnson vysvětlil, že později litoval svého rozhodnutí kariéru ukončit po nálezu viru HIV. Řekl, že odešel, protože "nechtěl ublížit hře".

Po ukončení kariéry napsal knihu o bezpečném sexu, podnikal, pracoval jako komentátor na NBC a cestoval po Asii, Austrálii a Novém Zélandu se svým týmem složeným z bývalých hráčů z ligy či Univerzity. V roce 1985 založil Johnson akci "Midsummer Night´s Magic", každoroční událost s exhibičním zápasem basketbalu a večeře s černou kravatou (požadavek formálního oblečení). Akce trvala po 20 let, než v roce 2005 skončila.